魂を揺さぶる絆のドラマと前人未到のスカイアクション。 アメリカのエリート・パイロットチーム“トップガン”は、絶対不可能な任務に直面していた。任務成功のため、最後の切り札として白羽の矢を立てられたのは、伝説のパイロット“マーヴェリック”。常識破りな性格と、組織に縛られない振る舞いから、一向に昇進せず、現役であり続ける彼は、なぜトップガンに戻り、新世代トップガンと共にこのミッションに命を懸けるのか？

ショーンと仲間たちがのんびり暮らす中、突如UFO がやってきた。 街はたちまち UFO フィーバーに沸き、牧場主も宇宙をテーマにしたアミューズメントパーク“FARMAGEDDON”を作り、一儲けをしようと企む。そんな中、ひょんなことから牧場に迷い込んだルーラは、ショーンたちと出会いすぐに仲良しになる。家族が恋しくなったルーラを家に帰してあげようと計画をたてるも、思いもよらぬハプニングが次々と巻き起こる。 ルーラを故郷に返すため UFO に乗り込んだショーンとビッツァーの運命やいかに――！